FlowJo(流式细胞分析软件)

FlowJo 10是一款非常不错的流式细胞数据分析软件，拥有非常强大的数据处理和分析功能，通过图像分析细胞的各种变化，结合细胞模型创建合理的数据分析平台，支持参数导出功能，可以兼容几乎所有流式仪器采集的数据，帮助用户轻松了解了解细胞的状态变化！

软件特色

1、阶梯式设门

FlowJo独特的阶梯式设门试一次革命性的创新。他一改传统复杂的逻辑门设置，将细胞群之间的逻辑关系用简单的递进阶梯式去呈现，并可以自定义细胞群名称、进而直观的现实细胞群统计值，让分析结果一目了然，简单清晰。

2、图像呈现法

①多维参数显示

FlowJo提供了灵活的数据呈现方式，全方位满足用户的数据分析需要。它可以呈现一维的直方图，传统的二维图形，及动态立体的三维图形，从多个角度和空间对数据进行360°的静态以及动态解析。

②多种图形类型

FlowJo除了提供传统的散点图，还提供多种图形类型（如密度图，等高图，伪色图，斑马图等），在满足不同分析需求的同时还保证了图像的美观和科学严谨需求。

3、多种设门工具

设门是流失数据分析中界定细胞目标群的必要手段，不管要检测的目标细胞群是规则分布还是不规则分布，小概率事件还是大概率事件，FlowJo提供了多种设门工具，从而让用户方便的界定各种细胞群。

4、强大的批量处理功能

用户可以做一个样品的门分析，然后将这个分析批处理应用到其他样品上；也可以做一个样品的图形分析，然后将这个分析批处理用到其他样品上。这样避免了对每一个样品进行重复性试验的分析，即保证了数据分析的一致性及灵活性，同时也极大地提高了分析的效率并且得到完美的分析结果。

①门的批处理

你可以将一个样品的门分析，批量应用到其他的样品上。整个过程只需要轻轻拖动鼠标就可完成，非常简单。

②图形分析的批处理

图像处理也可以用批量分析的方法，将一个样品的分析应用到其他样品上。

5、多种分析平台及工具

FlowJo自身包含了多个特殊的分析平台来满足细胞周期，细胞增殖，动力学（钙离子流量）等的分析。这些平台采用权威的已发表的模型算法原理设计，来精确模拟数据分布。FlowJo还包含了多种独特的分析工具，如数据联结、衍生参数轴、校准、Backgating、Show Ancestry、Sample Comparision等，让你对数据作进一步的深层分析及处理。

6、荧光补偿

荧光补偿是六十分析里面一个重要的概念也是一个复杂的过程，却是流式分析必不可缺的部分。软件补偿一改过去在机器上手动调节补偿的冗长复杂过程，大大简化了荧光补偿过程，将补偿数据的过程变成一个可理解，可见的简单过程，同时提供了在机器上手动补偿所没有的精确度和灵活性。

7、灵活方便的数据导出

数据的导出在FlowJo里面非常的轻松方便。不管是图形数据还是数据表格，都可以方便的导出成各种格式用来做数据的分享和发表。

软件功能

1、反向控制分析

一旦你的分析包含了门内门控产生的亚群，就可以看到一个给定亚群的源图形。反向控制分析显示在每个阶段的图突出最后亚群的每个门控操作图。

2、抗体面板向导

这个逐步的工具包含了许多供应商的抗体目录和你的流式细胞仪的配置，使抗体面板设计更精简的过程。它有一个在线网站，fluorish.com，在那里你可以与你的核心或实验室经理或同事联系，得到仪器的配置，搜索组抗体，抗体和购买。

3、细胞周期分析

软件有一个细胞周期的平台，采用多种模型对数据进行拟合，拟合参数的约束，并自动计算在G1期，细胞的百分比，或G2期。所有的模型都可以复制到其他的人群或样本中，使用相同的简单的拖放界面来传播其他的门或分析。

4、补偿

污渍的光谱重叠处理补偿工具在软件。计算补偿矩阵的接口是基于单染色控制样本的集合。然后您可以将这个补偿矩阵应用到多染色的样本中。软件增加了补偿参数多染色样品，这样你就可以查看和分析补偿数据。

5、导出参数

软件让你定义为样本的新参数。这些可能包括缩放参数（扩展感兴趣区域），时间参数（用于执行动力学分析），比率参数，或在log和线性缩放之间转换的参数。派生参数定义可以复制到整个组的样本中。

6、FCS扫描

FCS扫描工具将扫描本地或远程文件系统的FCS文件。当你想找到符合特定条件的FCS文件（污点协议、操作员ID、运行日期、机器等），或者当FCS文件被移动并需要重新定位时，这个实用工具就很方便了。

7、影视

分析平台独特的软件：查看你的数据动态。使用图形窗口或布局编辑器电影来生成图形作为时间的函数（动能分析），或者生成一个或两个参数作为第三的函数的图。这种独特的可视化可以让您发现数据中的微妙关系，否则将不可能看到其他的关系。

8、板编辑

一个全新的平台进行注释，分组和组织板基于流式细胞仪检测数据的元数据注释工具板，进口板材快速标注一个CSV文件，并能够设置标注滴定。

使用教程

如果你对不同的病人做相似的实验，你可以保存一个工作区作为一个模板，包含所有的门、统计数据、表格和布局。下周，当你和不同的病人做同样的实验时，大部分工作已经为你做完了！您只需将新的示例导入模板工作区即可。良好的模板设计节省了大量的软件分析时间和标准化报表。

1、将样本加载到工作区中。

2、为相关的示例、门等创建组。

3、详细分析单个示例，创建门户、统计数据等。

4、对组中的所有样本应用适当的分析。

5、检查组中样品的浇口：易于修改样品以适应样品变化。

6、生成一个图形布局，您可以在其中显示所有示例中的特定图形。

7、生成一个表，您可以在其中创建所有样本的特定统计信息。